LI-COR 4300 DNA Analyzer
Sistema de sequenciamento genômico, especialmente desenvolvido para análise por AFLP, Microssatélites, TILLING e ECOTILLING, sequenciamento convencional e "long-read" (>1kb).
Utiliza a inovadora tecnologia de detecção por infravermelho, mais acurada e livre de background e o software de análise (pacote SAGA MX/GT), que realiza leituras baseadas não apenas na intensidade do sinal, mas como também do perfil eletroforético das bandas, alimentando robusta base de dados (Oracle®). Em outras palavras, o software “aprende” a interpretar as bandas, facilitando a análise conforme o uso.
Pacote inclui equipamento e acessórios necessários:
• 4300: Seqüenciador (4300S ou 4300L)
• Buffer Tank
• Casting Stand
• Drying Rack
• Acessórios para instalação e Acessory Pack
• Manuais
• Software para sequenciamento "e-Seq" (acompanha licença para 1 computador)
• Software SAGA MX/GT (versão "Server" para instalação em até 5 computadores)
• Software para alinhamento de sequências "AlignIR" (acompanha licença para 1 computador)
• Acessórios para géis de 66cm de altura (4300L)
• Espaçadores - 66cm (4300L)
• Acessórios para géis de 41cm de altura
• Espaçadores - 41cm
• Acessórios para géis de 25cm de altura
• Espaçadores - 25cm
• Set de pentes - 0,2 mm
• Set de pentes - 0,25mm
• Pentes "membrane" para TILLING
• TILLING dipping tray
• Software suplementar - para experimentos de ECOTILLING
Especificações:
• Lasers
- Vida útil: 40000 - 60000 horas em média.
- Canal 700: Diodo (Estado sólido) Emissão: 685 nm.
- Canal 800: Diodo (Estado sólido) Emissão: 785 nm.
• Detectores:
- 2 fotodiodos "silicon avalanche"
• Velocidade de Scanning:
- Possibilidade de seleção entre 5 velocidades, otimizando a qualidade da imagem.
• Fonte:
- 5000V, 40mA, 120W.
• Especificações operacionais:
- 15 - 35ºC
- Seleção automática de voltagem (entre 90-250 VAC e 47-63 Hz). 3A, 120V; máximo 380W.
• Dimensões:
- 4300S: 59 x 51 x 47cm (23" x 20"x 18"). 102 cm (40") com a porta aberta.
- 4300L: 84 x 51 x 47cm (33" x 20"x 18"). 102 cm (40") com a porta aberta.
• Massa:
- 4300S: 29 kg (64 lb).
- 4300L: 36.3 kg (80 lb).
• Servidor interno:
- Capacidade de armazenamento: 80 GB, divididos entre armazenamento de dados e software
- Protocolo TCP/IP. Interface de rede (RJ-45, 10/100 BaseT) permite acesso via Intranet ou Internet, dependendo do modo de instalação
- Segurança: Acesso protegido por senha.
- Software compatível com Windows ME/XP/2000 (NÃO COMPATÍVEL COM WINDOWS VISTA).
- Garantia de 1 ano via fabricante e assessoria via Uniscience.
Reagentes disponiveis
Todos os reagentes necessários para análise de microssatélites, AFLP e sequenciamento para utilização no sequenciador genômico 4300 da LI-COR
Primers
IRDye 800 Infrared Dye Primers, Dried Pellet, 1nmol
Primer marcado com IRDye 800 para sequenciamento e genotipagem
829-05565 M13 Forward (-29) 5'-CAC-GAC-GTT-GTA-AAA-CGA-C-3'
829-05566 M13 Reverse 5'-GGA-TAA-CAA-TTT-CAC-ACA-GG-3'
IRDye 800 Infrared Dye Primers, Dried Pellet, 20 nmol
Primer marcado com IRDye 800 para sequenciamento e genotipagem
4000-20H M13 Forward (-29) 5'-CAC-GAC-GTT-GTA-AAA-CGA-C-3'
IRDye 700 Infrared Dye Labeled Primers, Dried Pellet, 1 nmol
Primer marcado com IRDye 700 para sequenciamento e genotipagem
829-05570 M13 Forward (-29) 5'-CAC-GAC-GTT-GTA-AAA-CGA-C-3'
829-05571 M13 Reverse 5'-GGA-TAA-CAA-TTT-CAC-ACA-GG-3'
IRDye 700 Infrared Dye Labeled Primers, Dried Pellet, 20 nmol
Primer marcado com IRDye 700 para sequenciamento e genotipagem
4200-20G M13 Forward (-29) 5'-CAC-GAC-GTT-GTA-AAA-CGA-C-3'
Reagentes para gel
KBPlusTM
Matriz pronta de gel composta de acrilamida, uréia e tampão TBE
827-05214 500ml de matriz para gel 3.7%
827-05215 500ml de matriz para gel 5.5%
827-05607 500ml de matriz para gel 6.5%
827-05667 KBPlus Combo 3.7% - 500ml de matriz de gel + 10x tampão TBE
827-05668 KBPlus Combo 5.5% - 500ml de matriz de gel + 10x tampão TBE
827-05669 KBPlus Combo 6.5% - 500ml de matriz de gel + 10x tampão TBE
Marcadores
125 lanes
4000-44B 50-350pb, IRDye 800
4200-44 50-350pb, IRDye 700
4000-45 50-700pb, IRDye 800
4200-60 50-700pb, IRDye 700
500 lanes
829-06157 50-700pb, IRDye 700
829-06158 50-700pb, IRDye 800
2500 lanes
829-05343 50-350pb, IRDye 700
829-05344 50-350pb, IRDye 800
829-05345 50-700pb, IRDye 700
829-05346 50-700pb, IRDye 800
Stop solutions
830-04997 4ml; vermelho
830-05043 200ml; vermelho
830-05629 4ml; azul
830-05630 200ml; azul
AFLP Kits
Template Preparation Kits
830-06198 AFLP® Template Preparation Kit
Selective Amplification Kits
para 1.600 reações aproximadamente (25 templates com 64 diferentes primers)
830-06197 AFLP® 2-Dye Selective Amplification Kit
830-06196 AFLP® IRDye 800 Infrared Dye Selective Amplification Kit
830-06226 AFLP® IRDye 700 Infrared Dye Selective Amplification Kit
Startup Kits (incluem os kits de preparação e amplificação)
830-06195 AFLP® 2-Dye Startup Kit
830-06194 AFLP® IRDye 800 Infrared Dye Startup Kit
830-06258 AFLP® IRDye 700 Infrared Dye Startup Kit
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